پیرو پیشروی ویروس کرونا و فراگیر شدن آن در تمامیه شهرهای کشور، در تاریخ 18 اسفند 1398 سازمان هواپیمایی کشور دستور محدودیت پرواز های کیش را صادر کرد. طی جلسه ای شورای عالی سلامت کیش، مدیر عامل سازمان منطقه آزاد کیش نامه ای به معاون وزیر راه و شهر سازی ارسال کرده است. سازمان هواپیمایی کشور طی تایید و موافقت با محدود کردن پرواز ها به جزیره کیش و لغو فروش تور و بلیط به این جزیره نیز بیانیه ای به مدیران شرکت های هوایمایی داخلی ارسال کرده است تا آگاهی و همکاری لازم را با سازمان منطقه آزاد کیش داشته باشند. با توجه به این تصمیم در روز های آتی پرواز های جزیره کیش محدود شده و شاهد لغو پرواز های تور کیش هستیم.